最近開發(fā)的敏感、特異、非培養(yǎng)方法的用于識別微生物的工具的應(yīng)用正在改變微生物生態(tài)學(xué)的概念，包括與我們自身以及與健康和疾病狀態(tài)相關(guān)的大量復(fù)雜微生物種群之間的關(guān)系。盡管大多數(shù)最初的工作集中于胃腸道微生物群落和胃腸疾病的關(guān)系,但目前興趣已經(jīng)擴(kuò)大到包括研究哮喘及其表型與氣道微生物的關(guān)系，胃腸道微生物之間的關(guān)系,免疫功能的開發(fā)、過敏和哮喘傾向的研究。在此，我們提供了關(guān)于哮喘患者和健康受試者之間氣道微生物組差異研究，以及環(huán)境微生物組、腸道微生物組、免疫功能和哮喘進(jìn)展之間的關(guān)系的研究。此外，我們提供了有關(guān)這些發(fā)現(xiàn)建議如何建立涉及直接操作腸道和氣道微生物組來治療和預(yù)防過敏性哮喘的廣泛的基本原理。

PRACTALL是由美國過敏、哮喘與免疫學(xué)會(huì)(American Academy of Allergy, Asthma & Immunology)和歐洲過敏與臨床免疫學(xué)會(huì)(European Academy of Allergy and Clinical Immunology)聯(lián)合發(fā)起的，旨在就過敏癥與免疫學(xué)領(lǐng)域的前沿課題提供基于證據(jù)的共同建議。PRACTALL 2017側(cè)重于研究已證實(shí)的微生物在哮喘、特應(yīng)性皮炎和食物過敏患者中的作用。通過概述有關(guān)其在變應(yīng)性疾病中的作用的重要知識空白以及填補(bǔ)這些空白所必需的策略。此外，還將對處置微生物組的方法上的進(jìn)展進(jìn)行回顧，確定哪些是有效的，哪些是無效的，以及作為將來干預(yù)過敏性疾病形成、進(jìn)展或兩者的基礎(chǔ)。

人體的免疫系統(tǒng)對攝入的無害抗原，包括食物蛋白，通常不會(huì)出現(xiàn)局部和全身免疫反應(yīng)，這一過程被稱為口服耐受。對食物蛋白的耐受性可能與胃腸道對大量共生微生物的耐受性機(jī)制密切相關(guān)。在這里，我們回顧了目前對食物耐受的免疫機(jī)制的理解，以及這些機(jī)制中出現(xiàn)的干擾如何促進(jìn)食物耐受的喪失和食物過敏的發(fā)展。討論了共生菌群在促進(jìn)食物耐受中的作用以及腸道失調(diào)與食物過敏的關(guān)系。越來越多的證據(jù)支持皮膚對食物抗原的敏感性，認(rèn)為這可能是導(dǎo)致耐受不能形成或耐受喪失的一種機(jī)制。對食物過敏進(jìn)行免疫治療的目標(biāo)是通過一些機(jī)制誘導(dǎo)對食物過敏原的持續(xù)脫敏，甚至是產(chǎn)生真正的長期耐受性，這些機(jī)制可能在一定程度上與天然食物耐受性的形成相重疊。

腸道微生物群可能在牛奶過敏的自然病中起作用。我們試圖研究早期腸道微生物群與牛奶過敏之間的關(guān)系。我們研究了226名牛奶過敏的兒童，他們在嬰兒期就被納入食物過敏觀察研究組。收集3 - 16個(gè)月時(shí)的糞便樣本，對患兒進(jìn)行縱向隨訪，進(jìn)行臨床評估、牛奶特異性IgE水平、入組時(shí)、6個(gè)月、12個(gè)月、之后每年進(jìn)行一次，直到8歲。腸道微生物組采用16s rRNA測序，微生物組分析采用微生物生態(tài)學(xué)定量研究(QIIME)、群落系統(tǒng)發(fā)育研究(PICRUSt)和元基因組譜統(tǒng)計(jì)分析(STAMP)。

① 益生菌是活著的微生物，適量使用可以給予宿主健康上的好處；② 本文描述了益生菌在氣道中可能的作用機(jī)制，特別著重于它們調(diào)節(jié)上皮屏障功能的能力及其與免疫系統(tǒng)的相互作用模式；③ 益生菌，主要是乳酸桿菌，可以促進(jìn)緊密連接和粘附連接的表達(dá)和調(diào)節(jié)，從而恢復(fù)有缺陷的上皮屏障；④ 這些益生菌通過模式識別受體(如類toll受體)與上皮屏障和免疫細(xì)胞相互作用，激活后可刺激或抑制各種免疫反應(yīng)。